Сотрудники РАН создали программу для быстрого поиска тайн иммунитета

Учеными создана программа, позволяющая анализировать множество виртуальных геномов и анализировать свойства иммунной системы человека, что ускорит поиски методов лечения болезней, связанных с нарушением иммунитета. Над ней работали сотрудники Института биоорганической химии РАН, сообщает журнал BMC Genomics.

«Наша программа оптимизирует работу исследователей и поможет разработать и проверить новые гипотезы о формировании и работе системы адаптивного иммунитета. Что особенно важно, анализ таких данных важен не только для теоретических исследований, но и практических задач. Например, новые знания в этой области необходимы для разработки новых методов лечения автоиммунных болезней, рака, а также аллергий», — сообщил Иван Звягин из Института биоорганической химии РАН в Москве.
Эта программа – VDJviz — доступна для скачивания. Ее может получить любой пользователь сети, посетивший сайт британского журнала, в котором опубликовано ее описание.
Необычное название программы обусловлено тем, что она анализирует – особые фрагменты генома человека V, D и J, которые отвечают за формирование рецепторов иммунных клеток и антител. В процессе борьбы с инфекцией эти участки «перемешиваются» друг с другом, благодаря чему наш иммунитет постепенно подбирает ключ к фактически любой болезни, а также порождает аллергии и аутоиммунные заболевания, такие как рассеянный склероз, «нацеливаясь» не на патогены, а на часть организма.
Такой процесс происходит в организме множество раз при созревании каждой В- или Т-клетки, в результате чего формируется огромный набор В- и Т-клеток, каждая из которых имеет уникальную структуру рецепторов, распознающих антигены. Сегодня ученые умеют «прочитывать» эти участки ДНК иммунных клеток, однако, благодаря огромному количеству их вариантов, обработка и анализ того, за что отвечает каждая комбинация из них, является крайне длительным и трудоемким занятием.
По словам Звягина, VDJviz поможет ученым экономить время и силы, при этом не обладая особыми навыками программирования и работы с компьютерным кодом. Команда ученых из ИБХ РАН подготовила как онлайн-, так и офлайн-версию этой системы анализа ДНК, что позволит ученым пользоваться ей наиболее удобным способом. Как надеются биологи, их разработка поможет нам раскрыть секреты работы адаптивного иммунитета человека и понять, что вызывает тяжелые болезни, связанные со сбоями в его работе.

Источник: http://ria.ru